Struktur
Das einzige Organ der Stiftung ist das Kuratorium. Das Kuratorium besteht aus mindestens fünf Mitgliedern.
Die Mitglieder des Kuratoriums können im Bedarfsfall einen Fachbeirat berufen, der das Kuratorium bei der Recherche von förderungswürdigen Personen, Projekten oder Institutionen berät und an der Umsetzung der Fördermaßnahmen mitwirkt.
Die Aufgabe des Kuratoriums besteht insbesondere in der Auswahl der durch den Lehrkörper St. Afra vorgeschlagenen Stipendiaten, in der Verwaltung des Stiftungsvermögens sowie in der Beschlussfassung über die Verwendung der Erträgnisse der Stiftung. Das Kuratorium kann darüber hinaus eine Person oder eine Institution mit der Geschäftsführung beauftragen.
Die Geschäftsführung der Mathias Kleyboldt Stiftung obliegt BFP Brune Financial Planning (Multi Family Office mit Sitz in Düsseldorf).